В 1045 г. Ани перешел под власть Византии, а в 1064 г. - был захвачен и разрушен турками-сельджуками. В 1125-1209 гг. - город несколько раз переходил из рук в руки сельджуков и Грузии, в 1236 г. - разорен монголами, в 1319 г. - сильно разрушен землетрясением. В XIV веке теряет свое значение как культурный и экономический центр. С 1534 года - в составе Османской Империи, в 1878-1917 гг. в составе Российской империи (по Сан-Стефанскому договору). После 1920 года - в составе Турции.